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高效液相是精密分析仪器，随着技术的改进，其对实验水质要求也越来越高，当今的高效液相，一般都要求用户使用超纯水定出平坦而没有波峰的基线以保证分析测试的灵敏度，但也有少部分企业，由于某些原因，使用纯净水或蒸馏水来进行试验，但是常达不到想要的效果。
专家表示，一般的纯净水、蒸馏水中，都含有少量离子和有机物等杂质，用以配制液相和洗脱液不仅可能污堵昂贵的色谱柱，也影响HPLC定出平坦的基线。工程师表示，瓶装纯净水的纯化工艺，通常包括吸附、过滤、反渗透等，对颗粒性有机物的去除效果较好，但对微量有机物的去除，却不能满足高灵敏度的高效液相的实验需求，并且，由于其包装通常多为PVC瓶，透氧率高，同时存在一定的化学溶出量，从而污染瓶中的纯净水，尤其是保存一段时间后，水质下降更多，因此表现在HPLC色谱图上，虽无特定吸收峰，但基线存在较严重的不稳干扰。
另外，有专家对重蒸水进行HPLC检测时发现，254nm和214nm在22-27分钟时都出现较强的吸收峰，这表明有疏水性较强的有机物污染，其原因应是蒸馏过程的共沸现象导致了某些挥发性有机物去除不彻底。
