高效液相色谱仪是利用混合物各组分在固定相和流动相中溶解、分配或者吸附等化学作用性能的差异，使各组分在作相对运动的两相中反复多次的受到上述各作用力而达到相互分离。高效液相色谱仪在食品分析，环境分析，生命科学，医学检验以及无机分析等多种领域中得到了广泛使用。一般来看，原则上80%-85%的有机物能够使用高效液相色谱仪进行分析。
　　一、高效液相色谱仪在食品分析中的应用：
　　1、食品营养成分的分析：氨基酸，蛋白质，色素，矿物质，维生素，有机酸（邻苯二甲酸、柠檬酸等）等分析。
　　2、食品添加剂的分析：抗氧化剂，防腐剂，甜味剂以及着色剂（像苋菜红、柠檬黄、靛蓝、亮蓝，胭脂红与日落黄等）等分析。
　　3、食品污染物的分析：霉菌毒素（如：黄杆菌毒素，黄曲霉毒素或者大肠杆菌毒素等），微量元素以及多环芳烃等分析。

　　二、高效液相色谱仪在环境分析中的应用：
　　多环芳烃（尤其是稠环芳烃）以及农药残留物质（氨基甲酸脂类或反相色谱）等的分析。

　　三、高效液相色谱仪在生命科学中的应用：
　　1、低分子量的物质：有机酸、氨基酸、有机胺、卟啉、类固醇、糖类以及维生素等分析。
　　2、高分子量的物质：多肽、核糖核酸、各种酶以及蛋白质等分析。

　　四、高效液相色谱仪在医学检验中的应用：
　　1、合成药物中：抗生素，抗忧郁药物以及黄胺类药等的分析。
　　2、天然药物生物碱：吲哚碱，颠茄碱和强心甙等分析。

　　五、高效液相色谱仪在无机分析中的应用
　　1、对阳、阴离子等的分析。